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Parajumpers Gobi Damen verwendet um Fragmente des napA Gen

Parajumpers Gobi Damen

Eine verschachtelte PCR mit vier Parajumper Jacken Düsseldorf degenerierten Oligonucleotiden geprimt wurde, für die spezifische Amplifikation von Parajumpers Gobi Damen Sequenzen aus dem Gen, das das periplasmatische napA Nitratreduktase codiert, entwickelt. Dieser Ansatz wurde verwendet, um Fragmente des napA Gen aus 10 Pseudomonas-Spezies und einer Moraxella sp amplifizieren., Vorher gezeigten in der Lage, den periplasmatischen Nitratreduktase-Aktivität exprimieren, von Rhodobacter capsulatus, und aus einer Frischwasser-Sediment extrahiert Community DNA. Die Aminosäuresequenzen von den napA Fragmente codiert wurden, um miteinander und mit den entsprechenden Regionen von verwandten Enzymen verglichen. Dieser Vergleich zeigt, dass die Verstärkung Protokoll ist spezifisch für den vorgesehenen Ziel. wurden Napa Sequenzen aus Community DNA amplifiziert dicht gruppierten, die ein gewisses Maß an Homogenität im Sediment Gemeinschaft hinweisen. Alle getesteten Gram-negative Stämme, die Aerobic-Nitratatmung gefunden periplasmatischen zu haben Nitrat-Reduktase-Gene., einige Stämme, die die Gene haben und Express sind jedoch nicht in der Lage aerobe Nitratatmung. Die PCR-Primer und beschrieben werden, die in zukünftigen Studien von Nitrat atmenden Populationen Amplifikationsprotokolle.
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